Добрый день.
Я думаю, что есть кишечные проблемы у Ильи - судя по очаговой аллопеции, скорее всего, дырявый кишечник, как у многих аутистов, плохо усваиваются вещества из кишечника. И конечно, стоит сделать анализ на антитела к элементам АКДС, посмотреть, что с титрами. Если понадобится работать с этим - применить антивакцины, но прежде подлечить слизистую кишечника - в разделе протоколов есть соответствующий протокол. На этом фоне "подкормить" организм микроэлементами - минералами, витаминами, это можно делать только улучшив усвоение из кишечника.
Быстро устает - тоже признак недостаточного усвоения пищи и выработки энергии. Так что кишечником прежде всего заниматься.
Насчет диеты - на практике существует довольно большое разнообразие подходов. Большинство пробуют диету - это самое логичное решение - чтобы проверить, что это дает. Если пробовать - прочтите в протоколах рекомендации по питанию, как сделать, чтобы резкий переход на диету не повлиял негативно. Некоторые родители пробуют без диеты, но с ферментами, расщепляющими глютен и казеин. Чаще всего это не является полной заменой диете, но такой подход существует. Ферменты можно такие
http://puremedix.com/ru/product/klaire-vital-zymes-chewable/. Если пойдете по этому пути, лучше попробовать все же снизить хотя бы количество белой пшеничной муки, больше кушать злаки - зеленую гречку, пшено, лен, овсянку БГ можно - чтобы хотя бы меньше была глютеновая нагрузка, козьи йогурты (другой тип казеина, который легче переносится организмом). Крупы замачивать - читайте тему по питанию в протоколах и там же протокол для залечивания слизистых - для улучшения усвоения. Если еще не сделали- сделайте копрограмму кала, чтобы посмотреть, как что усваивается и проверить анализами, что с глютеном и вообще пищевыми непереносимостями.